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冠状病毒突变

Lead Image©Полина Томтосова / Adobe Stock

德雷塞尔大学的科学家已经发现了开发了一个工具可以快速识别和标记冠状病毒突变。

他们认为,他们的工具可能能够帮助官员追踪新型冠状病毒Sars-CoV-2的传播,并确定社交隔离措施正在发挥积极作用的地方。

它还可以帮助发展治疗疫苗对于冠状病毒——帮助尽快结束COVID-19疫情。

确定冠状病毒突变

与任何病毒一样,冠状病毒的遗传密码在人与人之间传播时偶尔会发生轻微的变化或突变。

我们对这些冠状病毒突变了解得越多,我们对抗病毒的能力就越强。但是在它的3万个碱基对中识别突变基因组可能会很费时间。

在一个在预印服务器上发布bioRxiv4月16日,德雷克塞尔团队详细介绍了他们创造的一种可以加速这一过程的工具。

这种病毒的遗传密码在人与人之间传播时偶尔会发生轻微的变化。

该论文称,在分析了3832个冠状病毒基因组样本后,他们确定了序列上的17个位置,这些位置“对不同个体测序的病毒基因组之间的差异提供了高度信息”。

基本上,在这17个位置匹配的冠状病毒基因组样本,就其冠状病毒突变而言,都属于病毒的一个“亚型”。

该团队开发了一种工具,可以根据这17个位置生成任何冠状病毒序列的亚型标签,并使其可供研究人员使用通过GitHub

首席研究员盖尔·罗森在新闻发布会上说:“这相当于扫描条形码,而不是输入完整的产品代码。”“现在,我们都在努力更快地逛完杂货店。”

与COVID-19

罗森表示,跟踪冠状病毒的突变可以帮助我们了解病毒在地理上是如何传播的。例如,纽约流行的亚型与来自奥地利和法国的亚型相匹配,而不是来自意大利的亚型。

跟踪还可以让我们更多地了解遏制措施的效果——例如,如果一种亚型没有扩散到某一特定地区,我们可能会知道该人群的社交隔离措施正在发挥作用。

在整个COVID-19疫情期间持续跟踪冠状病毒的突变,也可以为我们如何治疗提供信息——毕竟,世界卫生组织流感病毒变异这样一来,研究人员就必须创造出一种新的疫苗每年都要与之斗争。

然而,根据德雷克塞尔团队对冠状病毒突变的分析,我们似乎不必担心COVID-19疫苗的突变。

Rosen说:“我们看到,病毒的两个似乎没有发生变异的部分正是负责进入健康细胞并包装RNA的部分。”

“这两个都是了解人体免疫反应、识别抗病毒疗法和设计疫苗的重要靶点,”她继续说。

不过,如果情况发生变化,我们开始看到冠状病毒以不同的方式变异,研究人员可能需要重点考虑他们如何计划治疗或预防感染——现在他们有了一种更快的识别冠状病毒突变的方法,这将不是一项令人生畏的任务。

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