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抗冠状病毒

主要图片由马特·米勒/华盛顿大学医学院提供

想知道如何足不出户就能抗击冠状病毒吗?

二十年来,小组[电子邮件受保护]该公司一直在提供免费下载的软件,这些软件可以利用设备的中央处理器(CPU)或图形处理单元(GPU)的额外计算能力,为生物医学研究人员运行计算密集型模拟。

[电子邮件受保护]现在,“自由思考”要求人们帮助它进行模拟,以帮助结束冠状病毒大流行,“自由思考”响应了这一呼吁。

计算机模拟有助于揭示蛋白质的多种潜在形式,但它们需要大量的处理能力。

Freethink It主管塞斯•戈尔丁(Seth Goldin)表示:“这是我个人口袋里的一个项目:利用一点技术知识,欣赏强大的cpu和gpu,推进科学,直接找到抗击冠状病毒的方法。”

在国内抗击冠状病毒

像所有其他生物一样,导致Covid-19包含的冠状病毒蛋白质氨基酸是一种由化学物质链形成的分子。

蛋白质在几乎在细胞内发生的几乎每个过程发挥作用,并且在它经历自发的“折叠”过程之后,这一角色将取决于蛋白质的形状。

一个单一的蛋白质可以折叠成多种形状,了解蛋白质的所有潜在形态对科学家来说非常有用。

如果科学家知道所有的形状,冠状病毒的蛋白质可以采取,例如,它们可能能够用“可用性位点”识别形状 - 地方药物疗法可以与蛋白质结合,防止冠状病毒感染人。

计算机模拟可以揭示蛋白质的潜在形式,但它们需要大量的处理能力来运行。

为了解决这个问题,斯坦福大学研究员Vijay Pande推出[电子邮件受保护]2000年,为慈善公民提供能力从个人计算机,游戏系统,或在某些情况下,即使是他们的智能手机也能够进行科学研究的能力。

随着我们的(处理)权力合并......

过去的[电子邮件受保护]项目专注于与一切相关的蛋白质阿尔茨海默病乳腺癌

他们的工作导致了200多个科学论文的出版 - 他们的模拟了“不可驾拉”埃博拉病毒蛋白甚至导致鉴定具有药物结合位点的结构,用于潜在治疗。

2月下旬,本集团的注意力对负责Covid-19负责的冠状病毒。

作为一家处理大量视频素材的公司,Freethink有几个强大的系统可供我们使用,所以我们决定加入这个项目。

为此,我们现在运行两个cpu(一个Intel Xeon Gold 6136(12核)和一个Intel Xeon Gold 6152(22核))和三个gpu(一个NVIDIA GeForce GTX 1080 Ti卡和两个NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti卡)[电子邮件受保护]模拟。

我们不是唯一与冠状病毒并肩作战的国家[电子邮件受保护],要么。这个组织最近得到了大量的支持。3月16日,它在推特上写道它正在努力跟上新任务的需求。

该集团现在与合作伙伴合作扩大,因此不要让当前短缺的作业不足阻碍您下载[电子邮件受保护]软件帮助Freethink战胜冠状病毒,一次一个模拟。

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