如何找到新的冠状病毒变体以及到目前为止我们所知道的

Omicron是一种新的“关注变体”,但仍然有很多我们不知道的。

寻找变体需要一致的努力。南非和英国是最早在全国实施的大国基因组监测努力至2020年4月,SARS-COV-2。

像声音一样令人兴奋的变体狩猎是通过对病毒呈阳性的样品的整个基因组测序进行的。与我们所知道的在南非和世界循环相比,此过程涉及检查获得的每个序列是否有差异。当我们看到多个差异时,这立即引起了危险信号,我们进一步调查以确认我们注意到了什么。

幸运的是,南非已经为此设定了很好的设置。这要归功于公共部门实验室结果的中央存储库国家卫生实验室服务,(NGS-SA),与私人实验室的良好联系,西开普省的省健康数据中心和最先进的建模专业知识

与我们所知的世界循环相比,变体狩猎涉及检查获得的每个序列是否有差异。当我们看到多个差异时,这立即引起了危险信号。

此外,南非有几个实验室,可以生长和研究实际病毒,并发现抗疫苗接种或先前感染形成的抗体能够中和新病毒的抗体。这些数据将使我们能够表征新病毒。

与“野生型”或“祖先” SARS-COV-2相比,Beta变体在人们之间的传播效率要高得多,并引起了南非第二大流行波。因此,它被归类为关注的变体。在2021年期间,又有一个名为Delta的关注变体分布在世界上的大部分地区,包括南非,造成的。第三大流行波

最近,网络进行基因组监测成员实验室的常规测序检测到了新的病毒谱系,称为B.1.1.529,在南非。2021年11月中旬在豪登省收集的77个样品有这种病毒。还报道了邻近博茨瓦纳和香港的少量报道。据报道,香港案来自南非的旅行者

世界卫生组织已经给B.1.1.529这个名称Omicron并将其归类为关注的变体,像Beta和Delta

为什么南非会提出关注的变体?

我们不确定。当然,这似乎不仅仅是监测循环病毒的共同努力的结果。一种理论是,具有高度损害的免疫系统,并且由于无法清除病毒而经历长时间的活跃感染的人可能是新病毒变异的来源。

假设是某种程度的“免疫压力”(这意味着免疫反应不足以消除病毒,但会施加一定程度的选择压力,从而“强迫”“迫使”病毒进化)创造了新变体的条件,以使新变体出现。。

尽管针对HIV患者进行了先进的抗逆转录病毒治疗计划,但南非的许多人患有晚期艾滋病毒疾病,并且没有有效治疗。已经研究了几个临床病例这个假设,但还有很多待了解。

为什么这种变体令人担忧?

简短的答案是,我们不知道。长答案是,B.1.1.529带有某些有关的突变。在此组合中没有观察到它们,仅尖峰蛋白具有30多个突变。这很重要,因为峰值蛋白是构成大多数疫苗的原因。

尽管我们可以做出一些预测,但我们仍在研究突变会影响其行为的程度。

我们还可以说,B.1.529的遗传特征与其他感兴趣和关注的循环变体截然不同。它似乎不是“ Delta的女儿”或“ Beta的孙子”,而是SARS-COV-2的新血统。

它的某些遗传变化是从其他变体中知道的,我们知道它们可以影响传播性或允许免疫逃避,但是许多是新的,尚未研究。尽管我们可以做出一些预测,但我们仍在研究突变会影响其行为的程度。

我们想了解传播性,疾病的严重程度以及病毒“逃避”接种或追回人中的免疫反应的能力。我们正在以两种方式研究这一点。

首先,仔细的流行病学研究试图找出新的血统是否显示了可传播性的变化,感染了接种疫苗或以前感染的个体的能力等等。

同时,实验室研究检查了病毒的特性。将其病毒生长特征与其他病毒变体的特性进行了比较,并确定了该病毒在接种或回收个体的血液中发现的抗体可以被中和。

最后,当考虑所有这些不同类型的研究的结果时,在B.1.1.529中观察到的遗传变化的全部意义将变得显而易见。这是一项复杂,苛刻且昂贵的事业,将继续几个月,但要更好地了解该病毒并制定了对抗它的最佳策略,这是必不可少的。

早期的迹象表明这种变体引起了不同的症状或更严重的疾病?

尚无任何临床差异的证据。众所周知,豪登省的B.1.1.529感染的病例迅速增加,该国第四大流行波似乎正在开始。这表明易于透气性,尽管它具有轻松的非药物干预措施和案例数量少的背景。因此,我们还不能真正分辨出B.1.1.529是否比以前普遍的关注变体Delta更有效地传输。

Covid-19更可能表现为老年人和长期病人的严重,常常威胁生命的疾病。但是人口群体通常最初接触到新病毒的人群年轻,流动性且通常是健康的人。如果B.1.1.529进一步传播,则可以评估其影响,就疾病的严重程度而言,可以评估其影响。

幸运的是,到目前为止已检查的所有诊断测试似乎都能够识别新病毒。

最终,我们对这种变体所知道的一切都强调,普遍的疫苗接种仍然是我们对严重Covid-19的最佳选择。

更好的是,似乎一些广泛使用的商业测定法显示了一个特定的模式:三个目标基因组序列中的两个是正面的,但第三个序列不是。就像新变体在现有测试中始终在三个盒子中滴答两个。这可能是B.1.1.529的标记,这意味着我们可以快速估计由于B.1.1.529感染每天和每个面积的阳性病例的比例。这对于几乎实时监测病毒的传播非常有用。

当前的疫苗是否可能预防新变体?

同样,我们不知道。已知案件包括已接种疫苗的人。但是,我们了解到,随着时间的推移,疫苗接种提供的免疫保护减弱,并不能防止感染太多,而是防止严重的疾病和死亡。开始的流行病学分析之一是研究了多少人被B.1.529感染了多少人。

B.1.1.529可能会逃避免疫反应的可能性令人不安。希望的是,高血清阳性率,已经被感染的人发现,几项研究至少会在一段时间内提供一定程度的“自然免疫”。

最终,到目前为止,关于B.1.1.529的一切已知的一切都强调,普遍的疫苗接种仍然是我们对严重的Covid-19的最佳选择,并与非药物干预措施,将在接下来的浪潮中帮助医疗系统应对很长一段路。

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